公安委員会調査部の別室。
公安委員会が管轄している管理教室の一つ。
ゼミのようなものだが、管理教室は特待生や上級審査学生が所属することも多く、※検閲済み※であり、※検閲済み※な為、一般生徒が在籍することはない。
第二特別教室は公安委員会調査部の一課だが、独自の権限を多く持っているため、別室とされている。
主に指定生徒の監視を任としており、調査員を派遣している。
また、第二特別教室の調査員は調査部別室という性格上、本名を名乗ることはほとんどない。
本名から魔術的な呪いなどを受ける可能性が高いためである。
そのため、本名を名乗る事はなく、だいたいは役職名や異能名、もしくは魔術名のみでやりとりをする。